Bên cạnh tác dụng tích cực loại bỏ các tế bào ung thư, hóa trị và xạ trị vẫn gây tổn thương đến những tế bào lành, tế bào khỏe mạnh lân cận. Nhất là các nguyên bào máu, tủy xương, tế bào chân tóc, các tế bào trong miệng, tiêu hóa, tim, phổi và hệ sinh sản... Gây ra các bệnh như mất trí nhớ, sơ hóa phổi dẫn đến khó thở... viêm thực quản và tiêu chảy. Trong đó điều trị bằng xạ trị có thể gây ung thư thứ phát.